Aucune étude botanique ne semble avoir été menée sur les Fonds de Chaleux, contrairement aux sites voisins plus connus (Aiguilles de Chaleux, Parc de Furfooz).
D'après des relevés préliminaires effectués en 2002-2003 (G. MINET, J.-Y. BAUGNEE et M. PAQUAY), on peut y reconnaître les groupements suivants:
- une frênaie-aulnaie fragmentaire à Fraxinus excelsior, Acer pseudoplatanus, Acer campestre, Carpinus betulus, Corylus avellana, Euonymus europaeus, Cardamine bulbifera, Allium ursinum, Lunaria rediviva, Anemone ranunculoides, Ribes uva-crispa, Adoxa moschatellina, Ranunculus ficaria, Ranunculus auricomus, Silene dioica, Persicaria bistorta, Anthriscus sylvestris, Arum maculatum, Filipendula ulmaria, Geum urbanum, Lamium galeobodolon, Hedera helix, Paris quadrifolia, Mercurialis perennis (localisé), Veronica hederifolia, Lathraea squamaria (rare), Viscum album (sur Acer campestre).
- une prairie de fauche abandonnée depuis de nombreuses années avec, outre de vastes plages d'Urtica dioica, également Dactylis glomerata, Holcus lanatus, Agrostis capillaris, Arrhenatherum elatius, Phleum pratense, Heracleum sphondylium, Alopecurus pratensis, Galium mollugo, Pimpinella major, Ranunculus repens, Stellaria holostea, Veronica chamaedrys, Angelica sylvestris, Stachys sylvatica, Cruciata laevipes, Filipendula ulmaria, Stellaria nemorum, etc. Cette zone a été plantée assez récemment de différentes essences feuillues (Fraxinus excelsior, Prunus avium, ...).
- un éboulis rocheux exposé au sud occupant le talus de la voie ferrée et colonisé par un boisement sec pionnier de Quercus petraea et Fraxinus excelsior, récemment recépés (printemps 2003) ainsi que des fourrés à Prunus spinosa, Ligustrum vulgare, Rubus sp., etc. Plusieurs espèces végétales thermophiles s'y rencontrent, tel que Vincetoxicum hirundinaria, Cardaminopsis arenosa subsp. borbasii, Orchis mascula, etc.
La faune recensée n'a pas encore fait l'objet de synthèse. Parmi les invertébrés, on peut mentionner notamment la capture, en avril 2003, de deux insectes nouveaux pour la faune de Belgique, à savoir le diptère Stratiomyiidae Actina chalybea (BAUGNEE, 2003) et le psoque Lachesilla bernardi, une espèce circum-méditerranéenne (SCHNEIDER et CARRIERES, 2008).
Quelques coléoptères ont été collectés sur le site au printemps 2013 (G. MINET et P. LIMBOURG): Ceutorhynchus napi, Ceutorhynchus roberti, Ceutorhynchus pallidactylus, Ceutorhynchus sulcicollis, Ceutorhynchus obstrictus, Leiosoma deflexum, Trachodes hispidus, Kyklioacalles roboris, Tropiphorus elevatus, Barynotus moerens, Bembidion decorum, Elaphrus riparius, Bembidion elongatum, Bembidion punctulatum, Bembidion properans, Archarius crux, Anthonomus pedicularius.
De même, une quinzaine d'espèces d'araignées ont été notées durant une visite à la même époque (B. SEGERS et P. LIMBOURG): Hylyphantes graminicola, Oedothorax fuscus, Oedothorax retusus, Gongylidium rufipes, Neriene peltata, Pachygnatha clercki, Kaestneria dorsalis, Trochosa ruricola, Trochosa terricola, Xysticus cristatus, Metellina mengei, Theridion pictum.