La plus grande partie de l'île principale est occupée par une ancienne prairie pâturée abandonnée, très nitrophile, dans laquelle apparaissent quelques espèces des friches et où se maintiennent quelques espèces de mégaphorbiaies alluviales.
On y observe principalement : Arrhenatherum elatius, Dactylis glomerata, Alopecurus pratensis, Cirsium arvense, Carduus crispus, Rumex obtusifolius, Anthriscus sylvestris, Urtica dioica, Galium aparine, Glechoma hederacea, Epilobium ciliatum, Tanacetum vulgare.
Dans l'eau de la Semois se développent de belles populations de Ranunculus fluitans (Ranunculion fluitantis) et, dans les anses calmes, Lemna minor et Spirodela polyrhiza (Lemnion minoris).
Les zones les plus intéressantes sont incontestablement les berges (abruptes généralement), les bancs de graviers exondés et l'îlot :
- sur les bancs de graviers, parmi les nombreuses espèces plus ou moins banales qui se développent, relevons la présence de Myosoton aquaticum, Ranunculus repens, Bidens tripartita, Potentilla anserina, Persicaria maculosa, Persicaria minor, Persicaria hydropiper, Impatiens noli-tangere, Rorippa amphibia, Gnaphalium uliginosum, Petasites hybridus, Atriplex prostrata, Cuscuta europaea, Mentha sp., etc. Les parties thermophiles de ces gravières abritent aussi Cymbalaria muralis, Verbena officinalis et surtout la rare Corrigiola litoralis dont c'est la seule station connue actuellement dans la vallée de la semois, ...
- l'îlot amont porte une mégaphorbiaie alluviale de très haute taille formée de Filipendula ulmaria, Eupatorium cannabinum, Lycopus europaeus, Lythrum salicaria, Glyceria maxima, Phalaris arundinacea, Elymus repens, Festuca gigantea, Epilobium hirsutum, Symphytum officinale, Stachys palustris, Achillea ptarmica, Scirpus sylvaticus, Urtica dioica, Mentha x verticillata, Calystegia sepium, Carex acutiformis, Myosoton aquaticum, Solanum dulcamara, Myosotis scorpioides, Lychnis flos-cuculi,... (Filipendulion). En bordure du groupement sont présents Glyceria fluitans, Eleocharis palustris, Juncus bufonius,...
Impatiens glandulifera est abondante partout. En dépit de son incontestable valeur esthétique, cette espèce envahissante constitue une vraie peste dans la vallée de la Semois.
Les berges rassemblent la majeure partie des espèces de la mégaphorbiaie citées ci-dessus, mais on y observe également diverses espèces des roselières comme Acorus calamus, Iris pseudacorus, Alisma plantago-aquatica, Butomus umbellatus, Sparganium erectum, Rorippa amphibia, etc.
Quelques arbres ou arbustes sont présents çà et là : Alnus glutinosa, Fraxinus excelsior, Salix alba, Salix caprea, Acer pseudoplatanus, Corylus avellana, ...