Le site du Fond d'Hérenne est constitué pour les deux tiers sud de prairies pâturées plus ou moins intensifiées mais aux bordures intéressantes, et pour le tiers nord de bois et de fragments de pelouses calcicoles. La végétation a fait l'objet de relevés ponctuels dans le cadre de la cartographie du site Natura 2000 (Vallée de la Wimbe) par le DEMNA (F. Etienne et X. Vandevyvre, 2005). Diverses autres observations ont été effectuées ultérieurement, en particulier à l'occasion du suivi de la population d'orchis bouffon (Anacamptis morio) découverte par D. Tyteca en 2011.
L'habitat le plus remarquable est la pelouse calcicole, très riche des points de vue botanique et entomologique. Cette formation herbeuse thermophile et xérophile occupe essentiellement la bordure sud du coteau boisé au nord du site. Bien que progressivement envahies par les buissons, ces pelouses sont accessibles aux bovins qui pâturent dans la prairie voisine, entretenant une structure très hétérogène de la végétation.
La flore regroupe un mélange d'espèces typiques des pelouses sèches, d'espèces des prairies de fauche maigres et d'ourlets mésophiles et thermophiles: brome érigé (Bromus erectus), brachypode penné (Brachypodium pinnatum), amourette (Briza media), laîche printanière (Carex caryophyllea), vulnéraire (Anthyllis vulneraria), grande marguerite (Leucanthemum vulgare), fromental (Arrhenatherum elatius), scabieuse colombaire (Scabiosa columbaria), achillée millefeuille (Achillea millefolium), brunelle commune (Prunella vulgaris), petit boucage (Pimpinella saxifraga), campanule à feuilles rondes (Campanula rotundifolia), trèfle des prés (Trifolium pratense), lotier corniculé (Lotus corniculatus), cirse acaule (Cirsium acaulon), brunelle laciniée (Prunella laciniata), bugrane rampante (Ononis repens), petite pimprenelle (Sanguisorba minor), hélianthème jaune (Helianthemum nummularium), koelérie pyramidale (Koeleria pyramidata), potentille printanière (Potentilla tabernaemontani), plantain lancéolé (Plantago lanceolata), liondent hispide (Leontodon hispidus), stellaire graminée (Stellaria graminea), laiche glauque (Carex flacca), knautie des champs (Knautia arvensis), ancolie commune (Aquilegia vulgaris), aigremoine eupatoire (Agrimonia eupatoria), serpolet couché (Thymus praecox) (localisé à une zone écorchée), gaillet jaune (Galium verum), renoncule bulbeuse (Ranunculus bulbosus), trèfle des montagnes (Trifolium montanum), platanthère des montagnes (Platanthera chlorantha), buplèvre en faux (Bupleurum falcatum), hippocrépide fer à cheval (Hippocrepis comosa), dompte-venin (Vincetoxicum hirundinaria), avoine pubescente (Avenula pubescens), grémil officinal (Lithospermum officinale), crépis des prés (Crepis biennis), réglisse sauvage (Astragalus glycyphyllos), genêt des teinturiers (Genista tinctoria), genêt ailé (Genistella sagittalis), polygala vulgaire (Polygala vulgaris), germandrée petit-chêne (Teucrium chamaedrys), primevère officinale (Primula veris), seslérie bleuâtre (Sesleria caerulea), etc.
Les fourrés sont largement dominés par le prunellier (Prunus spinosa) mais comportent divers arbustes calcicoles thermophiles comme le nerprun purgatif (Rhamnus cathartica), le genévrier commun (Juniperus communis), le rosier rouillé (Rosa rubiginosa), la viorne mancienne (Viburnum lantana), l'alouchier (Sorbus aria), etc.
Une coupe dans un peuplement de pins noirs sur la crête orientale ("A Golène") accueillait en 2014 une flore très diversifiée également (sur base d'un relevé de L.-M. Delescaille- SPW-DEMNA), avec entre autres le brachypode penné (Brachypodium pinnatum), le brome érigé (Bromus erectus), la laiche glauque (Carex flacca), la laiche digitée (Carex digitata), la laiche printanière (Carex caryophyllea), le gouet tacheté (Arum maculatum), le gaillet mou (Galium mollugo), l'euphorbe petit-cyprès (Euphorbia cyparissias), le fraisier des bois (Fragaria vesca), la violette de Reichenbach (Viola reichenbachiana), la fétuque de Léman (Festuca lemanii), la morelle douce-amère (Solanum dulcamara), l'épiaire des Alpes (Stachys alpina), l'ellébore fétide (Helleborus foetidus), l'eupatoire chanvrine (Eupatorium cannabinum), le myosotis des champs (Mysotis arvensis), le brachypode des bois (Brachypodium sylvaticum), la vesce des haies (Vicia sepium), ainsi que, parmi les arbustes, le noisetier (Corylus avellana), le hêtre (Fagus sylvatica), l'alouchier (Sorbus aria), l'aubépine à un style (Crataegus monogyna), le lierre (Hedera helix), le chêne pédonculé (Quercus robur), le chèvrefeuille des bois (Lonicera periclymenum), le rosier des champs (Rosa arvensis), ...
Un petit éperon rocheux à cet endroit accueille plusieurs espèces de pelouses dont l'hippocrépide fer à cheval (Hippocrepis comosa), la seslérie bleuâtre (Sesleria caerulea), l'arabette hérissée (Arabis hirsuta), ...
Sur le versant boisé proche, à l'exposition nord, on note le chêne sessile (Quercus petraea), l'épicéa commun (Picea abies), le bois joli (Daphne mezereum), la mercuriale vivace (Mercurialis perennis), l'euphorbe des bois (Euphorbia amygdaloides), le cornouiller sanguin (Cornus sanguinea), le dompte-venin (Vincetoxicum hirundinaria), etc.
Comme détaillé par TYTECA (2015), le site renferme une belle population d'orchis bouffon (Anacamptis morio) découverte en 2011 et comptant à ce moment-là pas moins de 350 pieds fleuris!
Plusieurs chênes poussant sur ce coteau présentent des caractères typiques du chêne pubescent (Quercus pubescens) sans que l'on puisse exclure leur origine hybridogène.