Le vallon du Tiefenbach est entièrement inclus dans le réseau Natura 2000 (site 33046 «Vallée de la Warche en amont de Bütgenbach») et a, dans ce cadre, fait l'objet de nombreux inventaires botaniques en vue de caractériser les habitats présents. Les relevés ont essentiellement été réalisés par deux agents du DEMNA: D. Kever en 2007 et O. Schott en 2012.
Un très bel exemple de prairie maigre submontagnarde se trouve en rive droite du Tiefenbach, sur le versant droit du vallon, à hauteur du bois de résineux isolé; le relevé regroupe plus de 55 espèces herbacées dont de nombreuses indicatrices des sols non amendés, y compris de la nardaie, notamment le nard raide (Nardus stricta), la bétoine officinale (Stachys officinalis), l'épervière piloselle (Hieracium pilosella), le fenouil des Alpes (Meum athamanticum), la tormentille (Potentilla erecta), la danthonie (Danthonia decumbens), le serpolet commun (Thymus pulegioides), la knautie des prés (Knautia arvensis), l'alchémille vert jaunâtre (Alchemilla xanthochlora), l'amourette (Briza media), la fétuque rouge (Festuca rubra), la gesse des montagnes (Lathyrus linifolius), la centaurée noire (Centaurea jacea subsp. nigra), le gaillet du Harz (Galium saxatile), le millepertuis maculé (Hypericum maculatum), la campanule à feuilles rondes (Campanula rotundifolia), la laîche bleuâtre (Carex panicea), la laîche printanière (Carex caryophyllea), la succise des prés (Succisa pratensis), la sanguisorbe officinale (Sanguisorba officinalis),
S'y joignent des espèces de bas-marais acides comme la violette des marais (Viola palustris), l'agrostis des chiens (Agrostis canina), la renoncule flammette (Ranunculus flammula), la laîche étoilée (Carex echinata), le gaillet des fanges (Galium uliginosum), la laîche vert jaunâtre (Carex demissa), ...
D'autres prairies du même type existent tout le long du cours d'eau, sous des variantes plus ou moins caractéristiques.
Le vallon est pauvre en collections d'eau stagnante. Outre l'étang relativement artificialisé près de la confluence de la Warche, il existe un petit étang allongé situé à quelques centaines de mètres en aval de la route de Mürringen. Selon un relevé datant de 2007 (obs. L. Derochette), on y observe un groupement flottant à petite lentille d'eau (Lemna minor), des herbiers aquatiques à callitriche à crochets (Callitriche hamulata) et à potamot nageant (Potamogeton natans) et une petite roselière à rubanier dressé (Sparganium erectum).
Les deux parcelles de la réserve Natagora situées dans la partie la plus en amont du vallon, l'une au nord de Josthaus et l'autre à la zone de sources, renferment une mosaïque de groupements de prairies humides et de pâtures incluant d'anciennes parcelles résineuses visées par des travaux de restauration.
Dans la parcelle au nord de Joshaus, on observe principalement:
- des prairies de fauche humides à angélique sauvage (Angelica sylvestris), bistorte (Persicaria bistorta), prêle des bois (Equisetum sylvaticum), canche cespiteuse (Deschampsia cespitosa), jonc à tépales aigus (Juncus acutiflorus), crépis des marais (Crepis paludosa), jonc épars (Juncus effusus), reine des prés (Filipendula ulmaria), etc.
- des prairies de fauche sub-montagnardes peu fertilisées à avoine dorée (Trisetum flavescens), gesse des montagnes (Lathyrus linifolius), bistorte (Persicaria bistorta), raiponce bleue (Phyteuma nigrum), géranium des bois (Geranium sylvaticum), alchémille vert jaunâtre (Alchemilla xanthochlora), millepertuis maculé (Hypericum maculatum), fenouil des Alpes (Meum athamanticum), sanguisorbe officinale (Sanguisorba officinalis), fétique rouge (Festuca rubra), agrostis à tiges capillaires (Agrostis capillaris), colchique des prés (Colchicum autumnale), kanutie des prés (Knautia arvensis), dactyle aggloméré (Dactylis glomerata), cerfeuil sauvage (Anthriscus sylvestris), succise des prés (Succisa pratensis), l'amourette (Briza media), la campanule à feuilles rondes (Campanula rotundifolia), la bétoine (Stachys officinalis), berce commune (Heracleum sphondylium), fromental (Arrhenatherum elatius), grande marguerite (Leucanthemum vulgare), etc.
- des prairies pâturées permanentes pas ou peu fertilisées ;
- des éléments de bas-marais acide à prêle des eaux (Equisetum fluviatile), comaret (Comarum palustre), laîche à bec (Carex rostrata), laîche noire (Carex nigra), épilobe des marais (Epilobium palustre), trèfle d'eau (Menyanthes trifoliata), ...
- des prés à joncs à tépales aigus avec la crépis des marais (Crepis paludosa), le cirse des marais (Cirsium palustre), le lotier des fanges (Lotus pedunculatus), la patience des prés (Rumex acetosa), le bouton d'or (Ranunculus acris), la laîche noire (Carex nigra), la houlque laineuse (Holcus lanatus), le populage (Caltha palustris), la fleur de coucou (Lychnis flos-cuculi), le gaillet des fanges (Galium uliginosum), la valériane dioïque (Valeriana dioica), l'agrostis des chiens (Agrostis canina), l'angélique des bois (Angelica sylvestris), la menthe des champs (Mentha arvensis), ...
On y trouve également quelques fourrés plus ou moins nitrophiles avec le sureau noir (Sambucus nigra), le saule marsault (Salix caprea), la chélidoine (Chelidonium majus), ...
En outre, la présence du Séneçon du Harz (Senecio hercynicus), espèce caractéristique de la Haute Ardenne, est signalée sur la parcelle.
Les parcelles situées aux sources du Tiefenbach hébergent la même mosaïque végétale avec en plus des éléments de nardaie montagnarde à fenouil des Alpes (Meum athamanticum), centaurée noire (Centaurea jacea subsp. nigra), nard raide (Nardus stricta), tormentille (Potentilla erecta), gaillet du Harz (Galium saxatile), luzule multiflore (Luzula multiflora), laîche à pilules (Carex pilulifera), succise des prés (Succisa pratensis), etc.
On y observe également un groupement des sols compacts humides à vulpin genouillé (Alopecurus geniculatus), un groupement à glycérie flottante (Glyceria fluitans), de petites plages de laîche blanchâtre (Carex canescens) et de très belles populations de trèfle d'eau (Menyanthes trifoliata).